廈門市地方稅務局于1994年9月由原廈門市稅務局分設成立。市局機關現內設辦公室、政策法規處、稅政一處、稅政二處、規費處、征收管理處、納稅服務處、計劃財務處、信息技術處(與信息技術分局合署辦公)、人事教育處、機關黨委、監察室12個處級機構及1個機關服務中心(事業編制);下轄直屬稅務分局、涉外稅務分局、稽查局、信息技術分局4個直屬機構，火炬高技術產業開發區稅務分局、象嶼保稅區稅務分局2個派出機構以及思明、湖里、集美、海滄、同安、翔安6個區地稅局。

在稅收征管方面，廈門市地稅局采取以屬地管理與行業管理相結合的管戶劃分原則，在市區范圍內實行“一級稽查”體制，形成以日常管理(以納稅評估為主線)、稅務稽查(以查案為主線)和法規部門(檢查監督)三者互相配合、互相制約機制。到2009年，全市地稅系統管征納稅戶共14.35萬戶，其中：企業9.17萬戶、個體工商業戶5.18萬戶。除地方稅收的征管外。廈門市地稅局還率先在全省實現社保“五險”地稅征收工作，其中2009年全市基本養老保險參保人數達到125.28萬、城鄉全民醫保參保人數78.8萬。2009年，廈門市地稅局共組織各項收入245.09億元,其中稅收收入(不含耕契兩稅)156.14億元，五項社保費68.52億元。

廈門市地稅局連續二屆榮膺“全國文明單位”稱號，并榮獲“福建省創建文明行業先進單位”、全國稅務系統信息化建設先進單位等榮譽;所屬思明地稅局榮獲“全國稅務系統文明單位”，集美地稅局和外稅分局榮獲省“五一”勞動獎狀，外稅分局、稽查局、思明區局、湖里區局、集美區局、同安區局連續評為“省級文明單位”;3個基層單位獲國家級“巾幗文明崗”，6個基層單位榮獲國家級“青年文明號”。

主要職能

1.貫徹執行國家的稅收法律、行政法規和規章;

2.組織征收本市各項地方稅收收入及附征的規費;

3.監督檢查本市各部門、單位貫徹執行國家稅收法律、行政法規和規章的情況;

4.結合本市實際情況，研究制定實施強化稅收征管及促進地方經濟發展的辦法和措施;

5.幫助指導納稅戶改善經營管理，提高經濟效益，不斷充裕稅源;

6.組織征收養老保險費、醫療保險費(含城鎮居民及未成年人醫療保險)、失業保險費、工傷保險費和生育保險費，代征殘疾人就業保障金。