南京林業大學教務處、教學評估辦公室負責制定全校本科教育的總體規劃;負責全校本科教學管理規章制度、管理文件的制定與實施;負責組織教學改革與質量工程建設項目的實施與管理;負責教學運行、學籍、考務、證書管理;負責教學質量監控、考評以及教學事故認定及處理;負責教師教育教學能力和教學管理隊伍的培訓;負責實踐創新訓練管理、教材規劃、建設與供應、現代教學技術的應用與管理等各項工作;負責學院(部)教學工作目標考核,實施教學質量評估。
現有正式在職職工27人,其中處級領導4人。下設教學科、教務科、教材科、考試中心、教育技術中心、教學質量科6個科級單位。